Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BBOF1Q8ND07 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms