Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
APCDD1LQ8NCL9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms