Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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