Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms