Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHDC7AQ5VTJ3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms