Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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RTL8BQ17RB0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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RTL8BQ17RB0 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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