Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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