Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NCAPHQ15003 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms