Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC3Q14574 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms