Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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FOXI1Q12951 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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FOXI1Q12951 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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FOXI1Q12951 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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FOXI1Q12951 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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FOXI1Q12951 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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FOXI1Q12951 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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FOXI1Q12951 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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FOXI1Q12951 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
FOXI1Q12951 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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FOXI1Q12951 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FOXI1Q12951 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FOXI1Q12951 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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