Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC1Q08554 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms