Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms