Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC172P0C7W6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms