Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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