Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms