Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTC7AQ9ULT0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTC7AQ9ULT0 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms