Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TINF2Q9BSI4 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms