Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms