Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms