Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFT2D3Q587I9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms