Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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