Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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