Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms