Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDE4BQ07343 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE4BQ07343 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms