Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BACE1P56817 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BACE1P56817 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BACE1P56817 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BACE1P56817 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BACE1P56817 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BACE1P56817 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms