Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB3P54753 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms