Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPA3P35244 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPA3P35244 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPA3P35244 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms