Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA7P31268 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms