Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
EGR1P18146 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms