Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF4P18085 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF4P18085 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF4P18085 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF4P18085 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF4P18085 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms