Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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