Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PMF1-BGLAPU3KQ54 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms