Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF6Q9Y4K3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF6Q9Y4K3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms