Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP15Q9Y4E8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP15Q9Y4E8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms