Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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