Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y278

HS3ST2, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST2Q9Y278 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HS3ST2Q9Y278 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HS3ST2Q9Y278 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HS3ST2Q9Y278 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HS3ST2Q9Y278 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HS3ST2Q9Y278 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HS3ST2Q9Y278 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HS3ST2Q9Y278 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HS3ST2Q9Y278 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HS3ST2Q9Y278 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HS3ST2Q9Y278 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms