Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HPS5Q9UPZ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HPS5Q9UPZ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms