Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF9BQ9UPX0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF9BQ9UPX0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms