Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN3Q9UPQ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms