Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHTF1Q9UMS5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF1Q9UMS5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms