Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRIP2Q9ULQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP2Q9ULQ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRIP2Q9ULQ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms