Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALD1Q9ULE6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PALD1Q9ULE6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALD1Q9ULE6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALD1Q9ULE6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALD1Q9ULE6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALD1Q9ULE6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALD1Q9ULE6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms