Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP3Q9UKI2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC42EP3Q9UKI2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms