Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FBXO3Q9UK99 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXO3Q9UK99 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms