Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY99

SNTG2, Gamma-2-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG2Q9NY99 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNTG2Q9NY99 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNTG2Q9NY99 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNTG2Q9NY99 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNTG2Q9NY99 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNTG2Q9NY99 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNTG2Q9NY99 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNTG2Q9NY99 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNTG2Q9NY99 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNTG2Q9NY99 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNTG2Q9NY99 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTG2Q9NY99 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms