Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COMMD8Q9NX08 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COMMD8Q9NX08 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COMMD8Q9NX08 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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