Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8A2Q9NTI2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms