Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms