Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDC42SE2Q9NRR3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms