Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms